2013年末，南山区各级各类中小学校67所，与上年持平；其中，小学36所，普通中学30所，中等职业学校1所；毕业生24102人，比上年降低1.3%；在校学生120534人，比上年增长5.7%；招生数30709人，比上年增长7.4%。2013年末，各级各类(公办)中小学教学用房60.4万平方米，增长1.9%；宿舍(含集体宿舍)18.3万平方米，与上年持平。
以下是根据学校的教学硬件环境、师资力量、教育的资金投入等信息进行综合排名，排出了深圳市南山最好的十所学校。对家长在选购住房、选择学校时予以参考。
| 排名 | 学校名称 |
| 1 | 育才第一小学 |
| 2 | 南头城小学 |
| 3 | 华侨城小学 |
| 4 | 海滨实验小学愉康部 |
| 5 | 北师大南山附小 |
| 6 | 海湾小学 |
| 7 | 珠光小学 |
| 8 | 南油小学 |
| 9 | 沙河小学 |
| 10 | 南山实验学校南头小学部 |