广州市第二中学创建于1930年8月，现应元路21号校区曾是广州著名的书院学海堂、菊坡精舍、应元书院的所在地，书香浓郁，闻名遐迩。
近代岭南的风流人物如：陈澧、朱次琦、梁鼎芬、梁启超等都曾在这块土地上学习过。1871年（清同治十年），在应元书院攻读的顺德举人梁耀枢高中辛未科状元，被传为“应元佳话”――风流人物的辈出，给斯地赋予了神奇与灵秀。
当前学校正步入跨越式发展阶段，努力打造三区四部“大二中”。三区是指：科学城校区、应元路21号校区、应元路7号校区。四部是指：科学城校区的公办性质的高中部，应元路21号校区的公办性质的初中部，应元路7号校区的国有民办性质的初中部（即二中应元学校）以及在应元路21号校区内的应元文化培训学校（为各年级学生，重点是高考落榜生的学业水平提高提供有效帮助）。
广州二中应元路21号校区（到2007年9月以后，为完全的初中部），是广州二中的母体，她北倚风光秀丽的越秀山，南临雄伟壮丽的中山纪念堂，毗邻省、市政府。早在1956年，学校就被广州市人民政府批准为市重点中学，1994年被评为广东省首批省一级学校。
广州二中科学城校区（2005年9月启用，为我校高中部）地处萝岗区科学城内的水西路上，倚苏元山（相传唐宋八大家之一的苏东坡曾在此结庐而读，因而得名）而建，校区内有天然山水汇聚成湖，是一所以“山水学府，生态校园”为理念构建而成的现代化一流学校。学校占地面积300亩，其建筑布局合理，气势恢弘，设计规模为60个教学班，3000学生，为当时之最。
在新的历史条件下，学校以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面推进素质教育，以培养现代化人才为目标，着眼于人的创新精神、实践能力、健全人格的培养与塑造，教育质量稳定，办学成果显著，形成了“合理负担高效益，因材施教高质量”的办学特色――我校的中考与高考的成绩长期处于广州地区的前列，两个毕业年级的工作连续多年荣获广州市一等奖。英语、语文、历史等学科都是公认的品牌学科。从上世纪80年代起，几乎每年都有总分或单科状元涌现，社会誉之“历史名校，状元摇篮”。
随着我校科学城高中校区的建成，“二中人”昂扬地拔锚起航，他们正以“创世纪伟业，铸时代品牌”的情怀，踏上风光无限的新征程！