广东仲元中学始创于1934年春，是为纪念孙中山先生的得力助手、著名民主革命家邓仲元先生而命名的一所纪念中学。辛亥革命元老胡汉民是首任董事长，著名政治家刘芦隐为第一任校长。后因胡汉民逝世,董事会改组，蒋介石为名誉董事长，余汉谋为常务董事长，校址设在广州文德路广雅书局内（今广州中山图书馆附近）。1942年正式命名为“广东省立仲元中学”。1937年抗日战争爆发后，学校先后迁往广州北郊蚌湖、韶关曲江鹤冲岗、粤东兴宁罗浮司乡、越秀山仲元图书馆办学。期间发生梁镜尧校长率仲元中学师生70余人与进犯日军展开血战，七英烈卫国捐躯事件，这英勇壮举令中外震惊，名垂千古。1946年8月，广东仲元中学迁至番禺市桥镇西郊大沙地继续办学至今。“文革”期间学校曾易名“市桥一中”、“番禺县第一中学”，1980年1月复名。
广东仲元中学拥有优良的革命传统和深厚的文化底蕴。解放后，一直是省、市、区的重点中学。1994年6月被首批评定为“广东省一级学校”，2006年4月首批通过广东省国家级示范性高中初期督导验收。是广东省新课程省、市级样本学校。学校现址占地70050平方米，建筑面积61280平方米。学校师资力量雄厚，高级教师和具有研究生学历的教师共88人，占专任教师的40%。学校拥有与办学规模相适应的校园和校舍，实验室、现代信息教育中心、艺术中心、体育中心、图书馆、探究性实验室、标准400米田径运动场、1000兆计算机互联网络等配套办学设施一应俱全。为适应现代化教育的需要，全校实现了计算机等“多机一幕”进课室，教师普遍使用计算机、多媒体组织教育教学活动。
学校全面贯彻党的教育方针，重视学生素质培养，科研兴校，科研促教，先后承担了多项国家、省、市级研究课题，其中学生心理健康研究课题，被中央教科所评为全国一等奖。学校先后获“广东省普教系统先进单位”、“全国体育传统项目先进学校”、“广东省群众体育先进单位”、“广州市文明单位”等荣誉称号。学校历年高考成绩优异，连续11年获广州市高三毕业班工作一等奖，2002、2003年高考综合分排名连续两年居广州地区第三名。2004年首次晋升为广州市A类学校。2006年高考再创新辉煌，高考综合评分获广州市高中毕业班工作一等奖第二名（仅次于华师附中），据统计：总分800分以上16人次，总分700分以上179人，重点本科512人，上线率为49.3%；本科884人，上线率为85.1%，上大专线以上1011人，总上线率为98.5%，居广州市同类学校前列，梁妍钰、梁烨妮同学分别以900分的优异成绩获2004、2005年语文科全省状元。学生田径队近六年来参加广州市（省一级学校）田径运动会，五次获团体总分第一名。广东仲元中学建校73年来，为国家培养了三万六千多名高、初中毕业生，仲元校友遍及五湖四海，为祖国的社会主义建设和人类文明的发展作出了积极的贡献，学校以“因材施教、注重实际、全面发展”的办学风格赢得了社会各届的好评。
广东仲元中学的建设和发展得到了各级领导和广大校友的重视和支持，学校的扩容改造计划现已基本完成。根据番禺区教育改革的整体部署，我校1998年改制为全日制高中，办学规模为60个班。今年学校计划招收高一新生20个班，共1120人，其中招收正取生920人，择校生200人。学校的录取工作安排在提前批进行，本着公开、公平的原则，我校将依据区招生办划定的分数线，由高分至低分择优录取，欢迎广大考生报考仲元中学。“十一五”的机遇已经来临，广东仲元中学将再接再厉，抓紧机遇，开拓进取、务实创新，在争一流、创名校活动中谱写历史的新篇章。