“南京重点中学”里指的“重点中学”和教育行政部门指的“重点中学”不是完全等同的。教育部门所谓重点中学，指的是“示范高中”，而我们这里指的南京重点中学是：办学质量较高，在家长中口碑较好，中考成绩出色的初中部，而不是任何官方的排名。
常见的较好的“南京重点中学”包括以下学校：
南京师范大学附属中学、南京市宁海中学、南京市第学二中学、南京市第四中学；
南京航空航天大学附属中学、南京市第一中学、南京市第六中学、南京市行知实验中学；
南京市第十二中学、南京市中华中学、南京市第十九中学、南京市第二十七中学；
南京市第九中学、南京市第三十四中学、南京市人民中学等；
南京市第五中学、南京市第二十八中学、南京市南湖第一中学；
此外还包括一批师资生源较好，教学质量较高的民办学校：
南京育英外国语学校、南京郑和外国语学校、金陵中学河西分校、南京南侨高级中学、南京秦淮外国语学校……