2016年5月中旬，生态城出台2016年初中招生办法，南开中学滨海生态城学校首次招收4个班。生态城小升初采用多校划片的方式招生，将天津外国语大学附属滨海外国语学校和南开中学滨海生态城学校结成一个学区片。学区片内的小学毕业生先填报一个入学志愿，对报名人数少于招生计划人数的初中，学生直接入学;对报名人数超过招生计划人数的初中，将随机派位。
2016年生态城小升初采取免试就近原则，招生对象为具有生态城户籍(含蓝印)的小学六年级应届毕业生。适龄儿童的户主、合法固定居所的产权所有人，必须是适龄儿童的父母、祖父母或外祖父母，户籍房产须为生态城内的独立产权住宅(具有房产证或完成备案的购房合同)。原房屋所有权人子女已在生态城入学(园)的，六年内不受理其二手房房屋所有权人子女报名。招生对象还包括：按要求于2015年完成入学登记，且为外省市学籍的生态城居住证持有人随迁子女。
2016年生态城初中招生(七年级)计划为：南开中学滨海生态城学校招收4个班，天津外国语大学附属滨海外国语学校招收4个班，视情况可适当增加。八、九年级转学，天津外国语大学附属滨海外国语学校招收八年级2个班，九年级1个班。