1993年，为了解决大学教职工子女读书问题，中山大学决定复办附属中学。顺应当时潮流，中大附中以国有民办的体制复办。16年来，复办后的学校秉承中山大学和中大附中的一切优良传统，坚持走内涵发展、打造精品学校的办学指导思想，谨守“博学、审问、慎思、明辨、笃行”的校训，从无到有，从弱到强，到目前为止，已成为广州市颇有影响的优质民办学校。学校不仅解决了符合条件的中大教职工子女的读书问题，而且还为大学子弟以外的学生提供了大量的优质学位。学校目前是广东省一级学校、广东省首届“十佳民办学校”，广州省现代教育技术实验学校，广州市科技教育先进学校。
中大附中地处中山大学校园，地理位置便利，自然风景优美，科学人文气氛浓郁，基础设施完善，管理服务优质，校风校纪纯良，教师队伍精干，学生品行端正、学业成绩上乘。中山大学和教育行政部门一直肯定，家长和社会一直称诵。
学校对学生的培养目标是：健康的体魄、健全的人格、全面的科学文化基础、突出的个性特长。学校始终坚持培养学生全面素质，关注学生品行塑造，提高文化科学知识，培养学生独立思考和创新的能力，尤其注重发展学生的特长。学校特别重视外语教育和科技教育。依托中山大学，附中目前开办有英语、日语和德语特色课程。科技教育课程形成体系，最有特色的项目是：机器人设计装配、电脑作品制作、科技创新大赛、MIT科技夏令营活动和校园科技节等。学生在区市省及全国的各类科技活动和竞赛中屡屡获得优异成绩，近年来师生在科技教育方面共获奖项300多人次，其中国家级奖项32项，省级奖94项。不少学生因为科技竞赛成绩突出而被保送重点大学。学校连续十年被评为“广州市科技教育先进集体”。2005年被评为全国“信息技术创新与实践活动先进单位”。李玉芬、刘勇斌等多位老师先后被评为广州市青少年科技教育先进个人或优秀科技教育辅导教师。